Dokumentowanie transakcji VAT marża

Witam,
mam kilka pytań, prowadzę sklep internetowy z obuwiem, jestem podatnikiem VAT + ryczałt. Część towaru pozyskuje od osób prywatnych, wtedy sporządzana jest umowa kupna sprzedaży wspominając że towar jest używany w celu odsprzedaży go jako VAT MARŻA. Inne osoby w branży do każdego paragonu wystawiają dodatkowo fakturę vat marża, i potem każda faktura jest księgowana osobno.
Księgowa powiedziała żebym na koniec miesiąca wystawiał fakturę wewnętrzną zbiorczą z podsumowaniem sprzedaży VAT MARŻA, tj. łączną kwotę sprzedaży, kwotę zakupu i kwotę marży, zamiast wystawiać każdą osobno. I tutaj moje pierwsze pytanie, czy takie coś ma w ogóle prawo bytu? Czy należy każdą fakturę VAT Marża księgować pojedynczo? Dodatkowo przesyłam format jak to wygląda od zaleceń księgowej. Część towaru jest również sprzedawana jako VAT23 ale z tym nie ma problemu.
Kolejne pytanie, gdyby urząd skarbowy się do tego przyczepił - jakie mogą być tego konsekwencje? I kto za to odpowiada?
Łącznie sprzedaży vat marża w miesiącu jest około 150-250.
Zdarzają się również pojedyncze sprzedaże vat marża do innych firm, wtedy faktura jest księgowana normalnie, przesyłam również przykładową fakturę.

Głównie rozchodzi się o to o czym wspomniałem, jeżeli udałoby się czegoś dowiedzieć lub skontaktować,  pewnie pojawią się kolejne pytania z tym związane. 
Liczę na poradę i kontakt :)
Pozdrawiam,