Czy można skutecznie złożyć VAT-R po terminie

Dzień dobry, wydarzyła się taka sytuacja:

klienta do wniosku CEIDG załączyła również wniosek o rejestrację do podatku VAT. Dokumenty złożyła na początku września, w dniu dzisiejszym okazało się, że do Urzędu Skarbowego wniosek nie dotarł. Urzędniczka twierdzi,że rejestracja w VAT możliwa jest dopiero od listopada- chciałam to potwierdzić Chciałam również potwierdzić, że za wrzesień musi rozliczyć się tylko z podatku należnego bez możliwości odliczenia kosztów.